南京军区福州总医院建于1949年，是一所集医疗、预防、保健、教学、科研为一体的大型综合性“三级甲等医院”，是国家卫生部国际紧急救援中心。医院占地1117亩，展开床位4000张，共有工作人员5000余名。医院下辖3个临床部，是全军唯一一所集陆海空为一体的总医院。2014年，医院年门急诊量360万余人次，年住院病人13万余人次，年手术量6.5万余台次。

目前，医院正在兴建综合性病房大楼，总面积18.09万平方米，将于2017年投入使用。医院位于福州市西湖之滨，交通便捷，绿树成荫、环境优美。

医院拥有一流的高、精、尖医疗设备，设备总值达7亿元。拥有先进的全自动检验系统，PET-CT、磁共振仪4台、高速CT机2台，全身γ-刀、光子刀、氩氦刀、头颅X-刀、直线加速器、ECT、DSA、数字胃肠机（DR）、数字拍片机（CR）、流式细胞仪、大型彩色多普勒仪、电子胃肠镜、电子显微镜、自动麻醉机、体外震波碎石机、全层流净化手术室、高压氧舱群等设备。

医院设有53个科室、42个专业学科，拥有1个国家级重点学科：国家中医药管理局肿瘤重点学科；9个全军级重点学科：全军临床检验医学研究所、全军器官移植研究所、全军儿科疾病诊治中心、全军妇产科中心、全军微创神经外科中心、全军计划生育优生优育研究所、全军临床药理基地、全军医院信息化研究与技术支持基地、全军卫生音像制作基地；12个南京军区重点学科：军区肝胆外科研究所、普通外科研究所、骨科研究所、肿瘤中心、药学中心、肾脏病中心、病理诊断中心、呼吸病中心、中医中心、消化内科中心、医学影像中心、糖尿病诊疗中心。拥有福建省和全军重点实验室各1个。是全军器官移植临床护理示范基地，福建省外科学研究生教育创新基地。

医院是福建省医疗系统第一家博士后科研工作站，目前共有在站博士后23名。医院是厦门大学附属东方医院，有45个博士、硕士联合培养点，是第二军医大学、第三军医大学、南方医科大学、福建医科大学临床医学院，第四军医大学、安徽医科大学、福建中医药大学、南昌大学医学院教学医院。

医院始终注重创新求发展，多项技术处于国内、军内领先水平。近年来，医院举办科技创新系列活动，创新人才培养机制，建立中青年科技人才培养制度，建立医院创新团队。目前，医院干细胞治疗技术临床研究居国际领先水平。女性尿失禁、肾移植、肝移植、脑癫痫外科、胃肠外营养、战创伤、人工关节置换、肾病、内镜外科、儿科心肾疾病、临床药学、中医内科、临床检验技术、血液净化技术、放射介入技术、病理诊断技术、微创技术、超声诊治技术等处于国内、军队、省内领先水平，部分技术达国际先进水平。动物实验室达到SPF级（屏障环境）标准。医院信息化建设居全国领先地位，是全国20家“数字化医院”试点示范单位之一。

医院拥有雄厚的技术力量。现有高级技术职称的专家313名，硕博士学位者323名，在国家、军队及省市担任各类学会学术职务的有320余人（次）。副院长谭建明、妇产科主任宋岩峰分别被表彰为“全国优秀科技工作者”。“十一五”以来，发表统计源期刊论文4849篇，SCI论文284篇，其中，谭建明副院长所领衔的原创性临床研究论著《亲属活体肾脏移植自体间充质干细胞诱导治疗》在美国医学会杂志（JAMA）发表，影响因子30.026分；获各类科研奖项97项，其中，国家科技进步二等奖1项，军队及省部级一等奖4项，二等奖37项。谭建明副院长领衔的“干细胞技术治疗糖尿病的转化研究”参与国家“863”项目，开展的“成体干细胞用于战时伤病救治的前沿技术研究”和检验科兰小鹏主任开展的“重要传染病防控关键技术与装备研究”，获全军医学科技“十二五”科研重大项目。《中华细胞与干细胞杂志》、《功能与分子医学影像学》两刊分别于2010、2011年获得国家新闻出版总署正式刊号并已创刊出版。在站博士后刘宽灿《靶向食管鳞癌促肿瘤发生蛋白SOX2及其复合物的特异肽适配子药物筛选和药效评价》获得国家863青年科学家项目。